SARS Envelope

슬롯-LED 팀은 SARS-COV-2 구조의 새로운 세부 사항을 발견합니다

계산 모델링은 입자의 외부 막의 더 미세한 견해를 보여 주며, 이는보다 효과적인 치료법과 백신으로 이어질 수 있습니다
2023 년 3 월 30 일
일러스트 레이터
Veronica Falconieri

새로운 슬롯-LED 연구는 COVID-19 바이러스의 구조적 세부 사항에 더 집중하여 신체에서 움직일 때“호흡”하거나 모양이 바뀌는 타원형 모양을 드러냅니다. 이 발견은 질병에 대한 새로운 항 바이러스 요법과 백신의 빠른 발달로 이어질 수있는이 발견은 4 월 판에 동료 검토 세포 프레스 구조 생물학 저널에 실 렸습니다.구조.

미리보기

Korkin

“이것은 미래의 전염병과 싸우는 데 필요한 중요한 지식입니다.”Dmitry Korkin, Harold L. Jurist '61 및 Heather E. Jurist Dean의 컴퓨터 과학 교수 및 프로젝트 연구원. “SARS-COV-2 바이러스 봉투를 이해하는 것은 세포에 부착하는 바이러스의 실제 과정을 모델링하고 분자 수준에서 치료법에 대한 우리의 이해 에이 지식을 적용 할 수 있어야합니다. 예를 들어, 바이러스 약물에 의해 바이러스 활동이 어떻게 억제 될 수 있습니까? 바이러스--러스의 상호 작용을 방해하기 위해 얼마나 많은 항 바이러스 차단이 필요한가? 프로세스.”

유전자 시퀀싱 정보 및 유전자 시퀀싱 정보 및 대량의 실제 바이러스에 대한 대량의 실제 데이터를 텍사스, Korkin 및 그의 팀의 슈퍼 컴퓨터로 옮겨 가면서Siewert-Jan Marrink네덜란드 그로 닝겐 대학교에서 지금까지 가장 강력한 현미경과 이미징 기술의 범위를 벗어난 바이러스 봉투 또는 외부 쉘의 계산 모델을 제작했습니다.

본질적으로, 컴퓨터는 구조적 생물 정보학 및 계산 생물 물리학을 사용하여 SARS-COV-2 입자의 모습에 대한 자체 그림을 만듭니다. 그리고 그 그림은 바이러스가 구형보다 타원형이며 모양을 바꿀 수 있음을 보여주었습니다. Korkin 은이 연구는 특히 M 단백질에 대한 이해를 높였다 : 바이러스 봉투의 과소 평가되고 간과 된 구성 요소..

 

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  • Dmitry Korkin
  • Harold L. Jurist '61 및 Heather E. Jurist Dean의 컴퓨터 과학 교수

M 단백질은 서로 사본과 함께 이량 체를 형성하고, 내부에 삼각형 메쉬 같은 구조를 제공하면서 구조를 전반적으로 유연하게 유지함으로써 입자의 형상 변화에 역할을하여 매우 탄력적이라고 ​​Korkin은 말했다. 대조적으로, 외부에서, 단백질은 Korkin의 결과를 보았던 과학자들을 당황하게하고 추가 연구가 필요할 수있는 신비한 필라멘트와 같은 구조로 조립됩니다..

Korkin은 연구자들이 개발 한 구조 모델은 SARS-COV-2 바이러스의 봉투 아키텍처와 이전 SARS 및 MERS 관련 발병에 대해 이미 알려진 것을 확장한다고 말했다. 그는 모델을 생성하는 데 사용 된 계산 프로토콜을보다 빠르게 모델링하기 위해 적용될 수 있다고 말했다. 바이러스 구조의 명확한 그림은 중요한 취약점을 드러낼 수 있습니다.

“SARS-COV-2의 봉투 특성은 다른 코로나 바이러스와 비슷할 것”이라고 그는 말했다. "결국, 코로나 바이러스 막 단백질의 특성에 대한 지식은 미래 바이러스에 대한 새로운 요법과 백신으로 이어질 수 있습니다."

새로운 결과에 게시구조제작에서 3 년이 지났고무료 슬롯 연구원은 코로나 바이러스의중국의 첫 번째 분리 된 균주의 유전자 서열 정보를 기반으로 바이러스의 첫 3D 로드맵을 제공하기 위해 전염병의 초기에.

미리보기 Dmitry Korkin은 코로나 바이러스 모델의 사진을 학생과 공유합니다.

연구 깊은 다이브

Korkin과 그의 팀이 SARS-COV-2 구조를 연구 한 것은 이번이 처음이 아닙니다실제로 그들은 지난 몇 년 동안 여러 연구 이정표를 달성했습니다. 2020 년 바이러스의 3D 로드맵 생성에서 동일한 모델과 데이터에 이르기까지스코틀랜드 예술가 Angela Palmer의 조각에 대한 영감, Korkin의 작품에 대해 자세히 알아보십시오.

Dmitry Korkin
Dmitry Korkin
나의 연구는 학제간에 있으며 복잡한 질병, 계산 유전체학, 시스템 생물학 및 생체 의학 데이터 분석의 생물 정보학의 분야에 걸쳐 있습니다. 우리는 머신 러닝, 데이터 마이닝 및 대규모 데이터 분석에 대한 전문 지식을 제공하여 분자 메커니즘을 연구하여슬롯 | 우스터 폴리 테크닉 슬롯소
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