소설 코로나 바이러스의 3D 모델을 가진 WPI 생물 정보학 프라그마틱 슬롯원 Dmitry Korkin.

COVID-19에 대한 WPI 프라그마틱 슬롯원 논문 viruses Journal

Dmitry Korkin 교수의 동료 검토 논문은 SARS 바이러스와 유사합니다. 새로운 코로나 바이러스의 3D 로드맵은“새로운 항 바이러스 및 백신에 대한 검색을 간소화하기 위해”
2020 년 4 월 15 일

소설 코로나 바이러스의 구조적 3D 로드맵을 만들어 전세계 과학 커뮤니티와 공유 한 지 2 개월 후 슬롯 사이트 (WPI) 생물 정보학 연구원Dmitry Korkin주제에 관한 논문을 게시했습니다바이러스, 선임 바이러스학 저널.

in피어 검토 논문, Korkin, WPI의 컴퓨터 과학 부교수 및 대학 책임자생물 정보학 및 계산 생물학 프로그램, 그와 그의 대학원생 프라그마틱 슬롯팀은 어떻게 생물 정보학 및 분자 모델링을 사용하여 주요 바이러스 단백질의 3D 구조와 인간 단백질과의 상호 작용을 재구성하는 방법을 설명합니다..

특히, 팀은 인간에게서 이전에 보지 못한 새로운 코로나 바이러스로 인한 새로운 질병 인 Covid-19와 유사한 3 개의 심각한 급성 호흡기 증후군 (SARS) 분리 물 (또는 표본)을 발견했습니다. 2003 년에 확인 된 바이러스 인 SARS는 또한 전 세계 감염과 상당수의 사망자를 일으켰습니다.

Korkin과 그의 팀은 바이러스를 모델링하고 미래의 약물 발견으로 과학자를 지원하는 데 참여할 수있는 세 가지 예비 결론에 도달했습니다. 먼저 그들은 새로운 코로나 바이러스를 구성하는 단백질의 변화가 고르게 분포되지 않았지만 인간 SARS 바이러스 및 다른 관련 동물 바이러스와 비교할 때 단백질 표면에 종종 형성된 것으로 판단했다..

둘째, 그의 그룹은 인간 항체에 의해 표적화 될 새로운 바이러스의 표면에있는 단백질 인“스파이크 단백질”의 영역이 SARS의 동일한 영역과 매우 다르며, 기존 SARS 백신이 효율적이지 않으며 새로운 백신이 필요하다는 것을 보여 주었다.

동시에, 팀이 제기 한 세 번째 결론은 이전에 개발 된 SARS 항 바이러스 약물 후보자가 목표로 한 지역이 현저하게 손상되었으며,이 약물의 용도가 가능하다는 것을 시사합니다..

Dmitry Korkin
Dmitry Korkin
나의 프라그마틱 슬롯는 학제간에 있으며 복잡한 질병, 계산 유전체학, 시스템 생물학 및 생체 의학 데이터 분석의 생물 정보학 분야에 걸쳐 있습니다. 우리는 머신 러닝, 데이터 마이닝 및 대규모 데이터 분석에 대한 전문 지식을 제공하여 분자 메커니즘을 프라그마틱 슬롯하여슬롯 | 우스터 폴리 테크닉 슬롯소
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바이러스의 간행물은 우리 팀이 개발 한 작업이 개발 된 작업을 강화시킨다. 시작 견적 시작 견적의 아이콘
  • -dmitry Korkin
  • 컴퓨터 과학 부교수

논문에서 Korkin은 계산 프라그마틱 슬롯의 쌍둥이 목표를 언급했습니다.

68932_69000바이러스, Open Access Journal은 월간 온라인으로 게시되었습니다. 그는“… 구조 로드맵과 관련 프라그마틱 슬롯 결과를 프라그마틱 슬롯 커뮤니티에 완전히 이용할 수있게 만들고 싶었습니다.”및“… 새로운 코로나 바이러스의 감염에 영향을 미치는 분자 메커니즘의 해독에 실험적인 과학자들이 백신 발달 및 항 바이러스 약물 발견에 포함 시켰습니다.”.

미국에서는 질병 통제 및 예방 센터보고4 월 중순까지 거의 580,000 건, COVID-19의 22,000 건 이상의 사망자. 에 따르면세계 보건기구, 사례의 수는 수백만 명에 이르렀으며 전 세계 10 만 명 이상의 사망자가 발생했습니다. 

2 월, Korkin과 그의 프라그마틱 슬롯팀무료 슬롯 연구원은 코로나 바이러스의 3D 로드맵을 전세계 과학자들과. 그 당시 Korkin은 질병에 대한 더 큰 프라그마틱 슬롯를 촉진하기 위해 전 세계 프라그마틱 슬롯원들과 로드맵을 공유했습니다..

프라그마틱 슬롯 커뮤니티에 신속하게 프라그마틱 슬롯 결과를 얻으려면 Korkin의 완전한 3D 구조 로드맵 데이터 세트와 원고 사전 인쇄물이 2 월 14 일에 게시되었습니다Biorxiv, 비영리 프라그마틱 슬롯 및 교육 기관인 Cold Spring Harbor Laboratory에서 운영하는 생명 과학의 미공개 전 프리 프린트를위한 무료 온라인 아카이브 및 배포 서비스.

Korkin은 출판물에 만족합니다바이러스, 그의 초기 작업을 검증한다는 점에 주목합니다.

“출판물바이러스70876_71194

Korkin의 작업은 두 개의 보조금으로 지원되었습니다. 국립 과학 재단 (National Science Foundation)은 계산 유전체학에 중점을 두 었으며 국립 보건원 (National Institutes of Health)의 2 년 보조금은 단백질에 의해 중재 된 상호 작용에 대한 돌연변이의 영향을 프라그마틱 슬롯하는 데 중점을 두었습니다.

프라그마틱 슬롯에 Korkin에 합류하는 것은 WPI PhD 학생 Hongzhu Cui, Ziyang Gao, Ming Liu, Senbao Lu, 중국에서 온 것입니다. 우크라이나의 Oleksandr Narykov; 인도의 Suhas Srinivasan; 중국의 석사 학위 Mo Sun; 그리고 말라위의 마스터 풀 브라이트 학자 인 Winnie Mkandawire.

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