“바다의 파지 호스트 역학 : 복잡한 상호 작용 네트워크를 풀고”
Nathan Ahlgren, 크레이지 슬롯
Clark University 부교수
2 월 24 일 월요일 오전 10시
게이트웨이 1002
(패스트리와 커피가 제공 될 것입니다)
파지 (박테리아를 감염시키는 바이러스)는 지구상에서 가장 풍부한 생물학적 실체이며 사망률과 진화 변화의 중요한 요원입니다. 파지가 호스트와의 상호 작용을 특성화하는 것은 미생물 시스템의 지역 사회 다양성, 구조 및 기능에 대한 영향을 이해하는 데 중요합니다. 해양 시아 노 박테리아와 그들의 파지 (cyanophages)를 사용 하여이 크레이지 슬롯는 복잡한 파지-호스트 상호 작용 네트워크를 분리하여 이러한 공동 발행 커뮤니티의 출현 패턴을 식별하려고합니다. 태평양과 대서양의 시계열 크레이지 슬롯와 함께 DNA 시퀀싱을 사용하여 파지-호스트 네트워크에서 계절성의 일반적인 패턴을 발견하여 시정애가 호스트의 주기적 패턴을 따르는 방법을 반영합니다. 그러나 개별 파지 '종'은 지속적 또는 확률 적 패턴을 가진 것들을 포함하여 더 다양한 역학을 가질 수 있습니다. > 100 숙주 및 파지 분리주의 감염 패턴을 조사함으로써 광범위한 감염 패턴을 발견합니다. 또한, 이들 감염 패턴은 숙주 게놈의 게놈 섬, 특히 파지 방어 유전자의 존재와 관련된 것으로 보인다. 우리는 함께 시간이 지남에 따라 고전적인 배양 기반 감염 분석, 게놈 분석 및 자연 공동체의 고 처리량 시퀀싱을 결합하여 다양한 Phage와 호스트 커뮤니티가 서로 구조화되고 서로 얽혀 있는지를 공개하고 있습니다..
